Tras su posesión, una de las primeras medidas en el área de seguridad que tomó el presidente Daniel Noboa, fue solicitar la renuncia de los 16 Generales que conformaban el Alto Mando de la Policía Nacional. De inmediato el mandatario y Mónica Palencia, ministra de Gobierno, empezaron una evaluación de todos los oficiales. Tras el análisis, Noboa confirmó a César Zapata como Comandante General. Zapata había sido nombrado por el entonces presidente Guillermo Lasso, para reemplazar a Fausto Salinas. Se aceptaron las renuncias de cuatro Generales. Se trata de Edwin Noguera, Pablo Ramírez, Manuel Samaniego y Marcelo López. Dos oficiales que ya formaban parte de la cúpula fueron trasladados a otras direcciones. Fausto Íñiguez, pasa de Migración a Inteligencia; y Freddy Goyes, de la Policía Judicial a Seguridad Ciudadana.